Der er relativt få arter i bøg på mor i forhold til de andre skovtyper. Der er således i gennemsnit registreret 9,2 plantearter i 5 m cirklerne i bøg på mor (Tabel 9110.102), hvilket er lidt flere end i kontrolovervågningen. Ud over bøg, der findes i alle dokumentationscirkler, er de hyppigst registrerede vedplantearter almindelig røn, stilk-eg (almindelig eg), ahorn, rød-gran og almindelig gedeblad, der alle forekommer i mere end en femtedel af dokumentationscirklerne (Tabel 9110.102.A). Og de hyppigst registrerede græsser og urter er bølget bunke, pille-star, håret frytle, skovsyre, miliegræs, mose-bunke og stor fladstjerne. Der er i gennemsnit registreret 4,6 arter, der er følsomme over for kulturpåvirkning i form af skovdrift, eutrofiering og afvanding (enstjernearterne). De hyppigst registrerede følsomme arter er pille-star, almindelig røn, håret frytle, skovsyre, stilk-eg (almindelig eg), miliegræs og stor fladstjerne (Tabel 9110.102.B).

Der er i gennemsnit registreret 0,01 arter, der er meget følsomme over for kulturpåvirkning i form af skovdrift, eutrofiering og afvanding (tostjernearterne). Det drejer sig om småbladet lind, tandbælg, stivtoppet rørhvene, lav tidsel, otteradet ulvefod og almindelig snylterod, der alle forekommer på ganske få forekomster med naturtypen (Tabel 9110.102.C).

Der er i gennemsnit registreret 0,2 problemarter i bøg på mor. Stor nælde er, som den eneste problemart ud over de invasive arter (Tabel 9110.103), registreret i 2,6 % af dokumentationscirklerne.

Der er registeret en eller flere invasive arter med en dækning på mere end 1 % på mere end to ud af fem af de kortlagte forekomster med bøg på mor inden for habitatområderne (Tabel 9110.103). På 3 % af forekomsterne er dækningen af invasive arter større end 10 %. Arter af lærk (almindelig europæisk lærk, japansk lærk og hybrid-lærk) udgør langt hovedparten af registreringerne og findes på 24 % af arealerne med bøg på mor. Derudover er fundet sitka-gran og almindelig ædelgran med en lav dækning på omtrent 1 % af forekomsterne, mens douglasgran, glansbladet hæg, stjerne-bredribbe, arter af ædelgran, kæmpegran og japan-pileurt findes på ganske få lokaliteter.