De mest betydende påvirkningsfaktorer for kystklint/klippe er begrænsninger af de naturlige processer, som naturtypens arter og deres sammenspil evolutionært er udviklet under.
Kystbeskyttende foranstaltninger (sandfodring, høfder, bølgebrydere, skråningsbeskyttelse, diger og dæmninger) og sediment- og sandflugtsdæmpende metoder (faskiner) begrænser de naturlige kystprocesser - oversvømmelser, erosion og aflejringer - som skaber og opretholder levestederne langs kysterne. Og rekreative aktiviteter i kystområderne kan lokalt føre til strandrensning, sandfodring og overudnyttelse. Historiske inddragelser af naturarealer til bebyggelse og infrastruktur hindrer også naturgenopretning, for eksempel når kystsikring opretholdes for at beskytte boliger og havneanlæg i stedet for at muliggøre frie kystprocesser.
Overalt i naturen er arterne tilpasset tilstedeværelsen af store planteædere året rundt, også på kystklinter og -klipper, men overvågningsdata viser, at her mangler græssende dyr. De vilde planteædere er til stede, men i unaturligt lave tætheder på grund af jagt, som reducerer vildtbestandene og ændrer dyrenes fødesøgnings- og bevægelsesmønstre. Fravær af en naturlig græsningsproces medfører en kaskade af effekter, såsom manglende variation i vegetationsstrukturen, tab af levesteder for varme- og lyskrævende arter og manglende kontinuitet af levesteder for møgbiller og møgsvampe.
Tilførsel af næringsstoffer fra direkte gødskning eller afdrift fra marker udgør også en betydelig påvirkning af naturtypen. Øget næringstilgængelighed favoriserer kvælstofelskende planter (især græsser) på bekostning af nøjsomme og langsomtvoksende arter samt deres tilknyttede insekter. Naturområdernes randzoner udsættes også for pesticider, der påvirker planternes blomstring og frøsætning og dermed også fødetilgængeligheden for bestøvende insekter.
Naturtypens tilstand påvirkes i mindre grad også af invasive plantearter, der tager plads fra de naturligt hjemmehørende arter.
Det forventes endvidere, at arealet og tilstanden af naturtypen kystklint/klippe i den nærmeste fremtid (de kommende 12 år) vil blive påvirket af klimaændringer i form af ekstreme temperaturer, havstigninger og ændret bølgepåvirkning.
Tabel 1230.204. Oversigt over de faktorer, der vurderes at have påvirket naturtypens tilstand i den aktuelle rapporteringsperiode (2019-2024). For hver påvirkningsfaktor er vist koden i den fælles europæisk liste (EIONET 2023), den danske gruppering og en kort titel, der beskriver påvirkningsfaktoren under danske forhold. Hver påvirkningsfaktor er karakteriseret ved dens betydning (høj, medium eller lav) og hvor stor en andel af naturtypens areal der vurderes at være påvirket (”omfang”). Timingen er ”igangværende” for alle faktorer, undtaget klimaændringerne, der er angivet som forventet i nær fremtid. En mere detaljeret beskrivelse af påvirkningsfaktorerne kan ses her.
